檳榔根系分為：主根、吸收根和氣生根。檳榔在種子發芽階段有明顯主根，在檳榔長到3-5片葉時，其主根死亡。吸收根，也稱營養根，主要為檳榔地下根系，屬于不定根，主要功能是吸收水分和養分。檳榔的氣生根分布在根莖周圍，也稱為節根，短而粗，表皮細胞發達，木質化部分含有大量的微孔細胞，這些微孔細胞與根系的通氣組織相連，中老齡樹比幼樹多，這些氣生根具有明顯的呼吸功能，有利于深埋在水中或沼澤地中的根尖吸收空氣（圖1）。
圖1 檳榔根系分類
檳榔根系終年生長，根系從各個不同方向伸出，水平分布面積隨株齡的增加逐漸擴大，并不斷從莖基部生長新的氣生根。但擴展性不高，水平分布范圍在30~100cm。在最初的3年內隨著幼苗的發育，越來越多的根隨著葉片的脫落而產生，與脫落的葉片相對應共有約10~12行根系形成。很有可能根系的形成限制于莖節的形成。
檳榔不同樹齡的根系顏色不同。1年生小苗的根系呈乳白色，再過2年呈淡棕色，隨著年齡的增長顏色逐漸變深，10年后顏色逐漸變深黑色。試驗表明，移栽前的小苗傷根后會影響到以后根系的生長和結果產量。
檳榔是典型的淺根性樹種，根型如團網狀。據此特征，在檳榔管理中，應注重上層土壤的水肥管理。幼齡樹結合施有機肥，定期擴大植穴，改良土壤環境，促進根系的良好生長。
檳榔的根系習性。檳榔根系為須根系,其根系密集著生于莖基部，為淺根系植物。其根系集中在0-40厘米深的土層。80厘米以下深度根系分布很少,甚至沒有。檳榔沒有明顯的主根,在各土層中均以<3毫米根所占比例最大。檳榔地上莖干的最下節生出大量新的紅色氣生根，扎入地下形成營養根，地下根系向外擴展，大部分根在表土層，無深根。由莖干節上長出的不定根稱次生根，約400多條，次生根又長出支根，不定根初期裸露在空氣中，之后可伸入土中，形成強大的地下根系。因沒有深根，導致檳榔容易受到土壤水分脅迫的影響，水分過多過少都會造成檳榔根系的損害。檳榔的根系也對除草劑十分敏感，除草劑的使用會對檳榔根系造成極大的損害。
護根與生根技術。在檳榔日常管理中，為促進檳榔根系生長，重點是將氣生根轉化為營養根，主要方法為地面覆蓋。地面覆蓋可采用地膜覆蓋、土覆蓋等（圖2）。此外還會采用化學調控的方式，主要采用埋施或澆溉營養物質與促根調理劑。
圖2：不同的根系覆蓋方式
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